2006年1月，公司被合肥市建筑業(yè)管理局授予“2005年度建筑業(yè)安全文明管理先進(jìn)集體”榮譽(yù)稱(chēng)號。
 2006年1月23日，公司榮獲“合肥高新區2005年度先進(jìn)單位”稱(chēng)號，新惠公司被評為“合肥高新區2005年度先進(jìn)集體”。
 2006年2月10日，公司被評為“合肥市2005年度衛生先進(jìn)單位”。
 2006年2月20日、5月 28日，“中央華庭”一期、二期工程開(kāi)工建設。
 2006年3月，因工作成績(jì)突出，貢獻顯著(zhù)，在慶祝高新區成立十五周年表彰大會(huì )上，公司被授予“合肥高新區突出貢獻企業(yè)”榮譽(yù)稱(chēng)號！
 2006年3月，高新區管委會(huì )下發(fā)合高管〔2006〕36號文件，明確合肥高新股份有限公司作為經(jīng)營(yíng)運作機構，全面負責蜀山西區的開(kāi)發(fā)建設。
 2006年4月29日、9月20日，“中央華庭”一期、二期開(kāi)盤(pán)銷(xiāo)售，在銅陵房產(chǎn)界創(chuàng )下了“中央華庭”現象。
 2006年4月，公司榮獲2004-2005年度“安徽省A級納稅信用先進(jìn)單位”稱(chēng)號。
 2006年6月19日，合肥市最大的復建社區—蜀南庭苑工程舉行開(kāi)工典禮，建成后的蜀南庭苑可容納居民近萬(wàn)人。
 2006年7月，經(jīng)公司第一屆董事會(huì )審議通過(guò)并報請高新區管委會(huì )批準，公司投資500萬(wàn)元參股安徽新創(chuàng )生物醫藥孵化有限公司，業(yè)務(wù)鏈條向生物醫藥行業(yè)延伸。
 2006年7月，環(huán)東新村順利交付使用。
 2006年7月，經(jīng)審議通過(guò)并報請高新區管委會(huì )批準，公司注冊資本由設立時(shí)的1億元增加到1.86億元，此舉為蜀山西區開(kāi)發(fā)提供了強有力的保障。
 2006年9月18日，興園二期工程完成竣工驗收。
 2006年9月，高新股份、火炬公司和新惠公司順利通過(guò)方圓標志認證委員會(huì )安徽評審中心組織的ISO9001：2000、ISO14001：2004和OHSAS18001：1999現場(chǎng)審核，獲得保持一體化管理體系認證資格。
 2006年11月18日，蜀南庭苑首期開(kāi)工的標段中，部分單體率先實(shí)現結構封頂。
 2006年11月，公司以“生態(tài)科技文化”主題，本著(zhù)“起點(diǎn)高、理念新、影響力強”的規劃設計理念，如期啟動(dòng)蜀山西區的概念性規劃邀請招標工作。
 2006年12月，根據公司股東合肥高新區科技實(shí)業(yè)發(fā)展公司的推薦，經(jīng)公司2006年第二次臨時(shí)股東大會(huì )和第一屆董事會(huì )第十次會(huì )議審議通過(guò)，王浩同志擔任合肥高新股份有限公司董事長(cháng)、總經(jīng)理。
 2006年12月，蜀山西區核心道路楓香大道工程開(kāi)工建設。楓香大道全長(cháng)4.6KM，雙向四車(chē)道瀝青砼路面，路幅寬度24M。
 2006年12月16日，興園二期住宅全面交付使用，2142戶(hù)居民喜搬新居。
 2006年12月，公司被合肥市委、市政府授予“合肥市第十屆文明單位”榮譽(yù)稱(chēng)號。這已是公司連續兩次獲此殊榮。
 2006年12月，經(jīng)公司2006年第二次股東大會(huì )審議通過(guò)并報請高新區管委會(huì )批準，公司注冊資本由1.86億元增加到3.21億元，與此同時(shí)，公司順利完成董事會(huì )、監事會(huì )的換屆工作。此舉進(jìn)一步壯大了公司實(shí)力，為公司的規范經(jīng)營(yíng)提供
 組織保證，為蜀山西區開(kāi)發(fā)向縱深推進(jìn)打下了堅實(shí)的基礎。
 2006年12月，蜀山西區啟動(dòng)區388畝農轉用土地申報獲得安徽省人民政府批準，為蜀山西區的實(shí)質(zhì)性開(kāi)發(fā)提供了重要支撐。
 2006年12月31日，蜀南庭苑首期12個(gè)標段、72棟單體全面實(shí)現結構封頂。